高通量測序樣品要求
組織/細胞樣品:
- 請使用新鮮取樣的實驗材料,當場分成小塊後立即用液氮或幹冰乙醇速凍,保存於-80°C冰箱,用足量的幹冰(根據經驗,在秋冬季節,如果打包合適,3公斤塊狀幹冰可以維持30-40小時)寄送;
- 於微生物樣品,請客戶如實聲明所屬物種,對於可能致病的微生物,生工保留拒收的權利;
- 對於需要進行RNA抽提的樣品,可以但不建議將組織在液氮中研磨後用TRIzol懸浮後用普通冰袋寄送,具體情況請先取得溝通。
環境樣品
- 如果是新鮮土壤/汙泥樣品,可以以冰袋運輸,不超過3天;
- 如果是凍存過的樣品(-20°C或者-80°C冰箱保存),為避免反複凍融,建議用足量的幹冰(根據經驗,在秋冬季節,如果打包合適,3公斤塊狀幹冰可以維持30-40小時)寄送;
- 如果是水體樣品,建議采用濾膜過濾後,將濾膜寄送來生工。生工不負責過濾。要求濾膜3張,冰袋運輸,不超過3天。其餘特殊環境樣品,具體谘詢生工高通量測序部。
DNA樣品:
請提供電泳膠圖,濃度>20 ng/μl,總量一般1~2 μg。乙醇沉澱DNA或凍幹DNA,可冰袋運輸,不超過3天。
RNA樣品:
- 請提供濃度≥750 ng/μl、總量≥2μg的總RNA樣品,樣品請去蛋白並進行DNase處理;
- 請務必提供每個樣品具體的濃度、體積、製備時間以及物種來源。最好附上QC數據,可以是電泳膠圖、分光光度值、Nanodrop儀器檢測數據或者Agilent Bioanalyzer儀器檢測數據等;
- 一般情況下,轉錄組測序需要Agilent Bioanalyzer儀器檢測獲得的總RNA 28S:18S≥1,RIN≥7;
- 小RNA測測序不可采用常規柱式總RNA提取試劑盒,可選擇傳統總RNA提取法(如乙醇沉澱、異丙醇沉澱等)或者選用專門的小RNA提取試劑盒;
- 寄送RNA樣品請置於1.5 ml離心管中,管上注明樣品名稱、濃度以及製備時間,管口使用Parafilm封口。在運輸前將所有樣品管固定於50 ml帶蓋離心管中,再將50 ml管放在封口袋中。使用足量的幹冰運輸,並且盡量選用較快的郵遞方式,以降低運輸過程中樣品降解的可能性。
其他特殊樣品:
ChIP項目至少要求50ng DNA,以Qubit 2.0檢測為準。其餘具體谘詢生工高通量測序部。
其他注意事項
- 請務必標記清楚並隨樣品附上樣品信息單;
- 樣品請自行保留備份,以便在出現外源汙染的情況時能迅速查清原因;
- 項目完成數據提交後,我方不保存樣品,項目結束一個月後將予以清理。