毛細管電泳(STR/SSR/AFLP/T-RFLP)基因檢測
服務簡介
公司依托3730XL 測序儀檢測平台專門開發了針對基因長度多態性進行檢測項目,包括STR/SSR、AFLP、MLPA 和T-RFLP 檢測和實驗項目。STR/SSR(Microsatellite,微衛星標記)也稱為短串聯重複序列(STR)或簡單重複序列(SSR),是廣泛分布在真核生物基因組中的簡單重複序列,因此被認為是繼限製性片段長度多態性(RFLP)之後的第二代遺傳標記,廣泛應用於遺傳製圖、基因定位、法醫學鑒定、人類學以及遺傳病的診斷等許多領域的研究。AFLP(amplified fragment length polymorphism,擴增片段長度多態性)是由荷蘭科學家Pieter Vos 等於1995 年發明的分子標記技術,是基於PCR 技術擴增基因組DNA限製性片段,基因組DNA 先用限製性內切酶切割,然後將雙鏈接頭連接到DNA 片段的末端,它結合了RFLP 和PCR 技術高效性特點,用熒光標記的引物進行PCR 擴增,產物進行毛細管電泳檢測,可使某一品種出現特定的DNA 譜帶,得到某物種DNA 多態性的指紋圖譜。MLPA(multiplex ligation-dependent probe amplification,多重連接探針擴增)於2002 年由Schouten 等首先報道,是近幾年發展起來的一種針對待檢DNA 序列進行定性和半定量分析的新技術,基本原理包括探針和靶序列DNA 進行雜交,之後通過連接、PCR 擴增,產物通過毛細管電泳分離及數據收集,分析軟件對收集的數據進行分析得出結論,目前已經應用於多個領域、多種疾病的研究。T-RFLP (Terminal restriction fragment length polymorphism,末端限製性長度多態性)技術是發明於上世紀末用於分析環境微生物多樣性的一種新方法,其原理是在RFLP引物的一端加上熒光標記進行PCR、產物經酶切後用3730XL 測序儀檢測,檢測結果以峰的位置和麵積表示微生物的種類和數量,進而反映目標微生物群落的組成及時空動態,目前T-RFLP技術已被廣泛用於分析各種環境中某類微生物的群落結構。
主要流程
STR/SSR
T-RFLP
AFLP
MLPA
訂購信息
服務名稱 | 說明 | 周期 | 報價 |
STR/SSR/T-RFLP/MLPA等直接檢測 | 客戶直接提供熒光標記PCR產物3730XL測序儀檢測 | 3日 | 詢價 |
STR/SSR實驗服務 | 引物設計、PCR、檢測、數據分析等 | 4-6周 | |
T-RFLP實驗服務 | 包括引物設計、PCR、酶切、檢測、數據分析等 | 3~5周 | |
AFLP實驗服務 | 包括訂製試劑盒、酶切、PCR、檢測、數據分析等 | 3~5周 | |
STR/SSR引物開發 | 至少開發10對有效引物 | 6~8周 |
客戶提供
提供樣品
血液樣品:樣品為EDTA 抗凝或枸椽酸鈉抗凝,樣品量大於0.5 ml,樣品采集後於-20°C 或-80°C 保存;
動植物組織樣品:樣品可以為新鮮組織(最好-80°C 保存),也可以是95%乙醇中固定的組織,組織量大於500 mg;
DNA 樣品:純度OD260/OD280 在1.8-2.0,STR/SSR/T-RFLP,濃度≥ 20 ng/μl,總量>20 μl;AFLP/MLPA 濃度≥ 100 ng/μl,總量>501 μl。
提供信息
基因信息:待測STR/SSR 位點、序列或引物;
AFLP 需要提供所用內切酶名稱、接頭引物及PCR 標記引物信息;
T-RFLP需要提供檢測基因,如16S、18S 或其它基因及引物,內切酶名稱等;
MLPA需要提供待基因信息,MLPA探針試劑盒號等。
交付
交付報告
實驗報告(實驗步驟,材料方法,結果等)、PCR 電泳照片、原始文件、PDF 格式蜂圖、Excel 表格數據。