基因焦磷酸測序檢測
服務簡介
焦磷酸測序(Pyrosequencing)技術是由4 種酶(DNA 聚合酶(DNA polymerase)、ATP 硫酸化酶(ATP sulfurytase) 、熒光素酶(luciferase)和三磷酸腺苷雙磷酸酶(Apyrase))催化的同一反應體係中的酶級聯化學發光反應。每一輪測序反應體係中隻加入一種脫氧核苷酸三磷酸(dNTP)。如果該dNTP 與模板配對,則會在DNA 聚合酶的作用下,添加到測序引物的3'末端,同時釋放出一個分子的焦磷酸(PPi)。摻入的dNTP和釋放的PPi 是等量的。CpG 甲基化焦磷酸測序檢測法基於引物延伸的Pyrosequencing 技術,通過將鏈合成過程中釋放出的焦磷酸(PPi)轉化成光信號來監測鏈的合成過程。該測序平台可應用於各種遺傳多態性標記的分析檢測,如SNP、突變、插入/缺失、甲基化、基因拷貝數等;等位頻率分析;此外,還可應用於各種微生物的鑒定、分型、耐藥性評估,並可對多種亞型或野生株及突變株、耐藥株組成的複雜群體中的各個組分含量直接加以定量評估。
主要流程
訂購信息
服務項目 | 服務內容 | 周期 |
基因焦磷酸測序檢測 | 服務項目包括:直接上機測序、CpG甲基化位點定量檢測、轉錄組mRNA水平突變點定量檢測、基因組DNA水平SNP位點檢測和微生物分型及耐藥基因檢測 | 1~6周 |
客戶提供
提供樣品
血液樣品:樣品為EDTA 抗凝或枸椽酸鈉抗凝,樣品量大於0.5 ml,樣品采集後於-20°C 或-80°C保存,低溫(≤ -4°C)運輸。
組織樣品:樣品可以為新鮮組織(最好-80°C 保存)或石蠟包埋的組織,也可以是95%乙醇中固定的組織,組織量大於100 mg。
DNA 樣品: 純度OD260/280 比值為1.8-1.9,濃度≥ 50 ng/μl,體積≥ 50 μl。
提供信息
基因信息:提供甲基化待測序列和微生物分型及耐藥基因(≤ 60 bp)及上下遊保留300 bp、SNP位點的RS 號。
交付
交付報告
實驗報告(包括實驗過程、方法、耗材試劑等)、焦磷酸測序PDF 文件。