菌種鑒定
服務簡介
通過DNA 測序對微生物進行物種鑒定(菌種鑒定)是比傳統生化鑒定更先進的鑒定方法。DNA 測序不依賴菌種本身特點,對所有菌種均可使用。比傳統生化鑒定更加快速,準確。生工提供的微生物物種鑒定服務包括細菌16s rDNA鑒定和真菌26s rDNA鑒定、真菌ITS和真菌18s 鑒定。
主要流程
基因組DNA提取
通用引物PCR擴增
PCR產物回收
測序或克隆測序
數據庫比對
訂購信息
服務名稱 | 說明 | 周期 |
16s rDNA部分序列分析 | 可進行PCR產物測序、序列對比和克隆測序、序列對比 | 5~15個工作日 |
ITS全序列分析 | 可進行PCR產物測序、序列對比和克隆測序、序列對比 | |
18s rDNA全序列分析 | 可進行PCR產物測序、序列對比和克隆測序、序列對比 | |
26S rDNA D1/ D2 區序列分析 | 可進行PCR產物測序、序列對比和克隆測序、序列對比 |
客戶提供
提供樣品
基因組DNA:濃度≥ 10 ng/μl,總體積≥ 20 μl,革蘭氏陽性細菌由於細胞壁較厚,最好提供基因組DNA;
帶有單菌落的平板或斜麵:應長有至少分離三次以上的單菌落。
交付
交付報告
PCR 產物照片;
菌種鑒定NCBI 參考結果;
測序彩色波形圖;
測序方向圖;
序列堿基圖。