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small RNA測序
項目簡介

Small RNA是一類重要的體內調節分子,長度在18-30 nt之間,主要包括miRNA、piRNA和siRNA。它的功能主要是誘導基因沉默,參與基因轉錄後調控,從而調節細胞生長、分化,以及個體發育、生殖等重要生物學過程。高通量測序技術可以對樣本中所有small RNA家族進行測序和表達定量,從而解析miRNA、siRNA、piRNA和其它非編碼RNA以及相應靶序列。

技術支持

Tel: 021-57072097
021-57072177

E-mail: rnaseq@sangon.com
rnaseq2@sangon.com

測序使用Illumina Xten平台,測序原始數據質控後,進行Clean reads 長度分布統計,small RNA注釋,已知 miRNA 注釋,已知piRNA注釋,ncRNA分析,新 miRNA 預測(有參考基因組),差異基因可視化分析,miRNA 家族分析,差異表達 miRNA 聚類分析,miRNA靶基因預測,靶基因GO、KEGG富集分析。

  1. 分析項目
  2. 樣本要求
  3. 常見問題
  4. 案例展示
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提供樣品

組織樣品或者總 RNA, 樣品名稱清晰,幹冰運輸。 具體要求參看官網高通量測序介紹頁麵中的《RNA類高通量測序樣品要求》。

提供信息

告知物種信息以及對照與實驗樣品(如有分組,詳細描述分組分析信息)

交付

  1. 測序原始數據
  2. 實驗結果類文件
  3. 分析報告以及分析結果文件
  4. 部分發表文章用的方法描述
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