SMART-seq2 服務
項目介紹
技術原理
SMART-seq（Switching mechanism at 5’ end of the RNAtranscript）是由美國和瑞典科學家於2012年共同開發的一種單細胞轉錄組測序技術，其能夠檢測mRNA 的全長，從而實現了轉錄本異構分析分析和 SNV 檢測。2013年，Nature Methods 雜誌上報道了 SMART-seq2，該技術是經 SMART-seq 改進的一種測序方法，也是目前最常用的單細胞轉錄組技術之一。
該技術通過設計 oligo（dT）VN Primer 作為逆轉錄引物，利用 MMLVRT 的模板轉換活性，在 cDNA 的3’端添加一段接頭序列，通過該接頭序列進行反轉錄，生成 cDNA 第一條鏈。當逆轉錄酶到達mRNA 5’末端時，會連續在末端添加幾個胞嘧啶（C）殘基。然後添加 TSO 引物，退火後結合在第一條鏈的3’端與 poly(C) 突出雜交，合成第二條鏈。這樣得到的 cDNA 經過 PCR 擴增，獲得納克級的 DNA，純化後可用於測序。
技術特點
適用於低起始量
一個細胞起始（100個以內的少量細胞），適用於難以滿足10x Genomics 等高通量平台起始細胞量要求的樣本；
可檢測 mRNA 全長
測序可覆蓋全長 cDNA 序列，單個細胞檢測基因數量多，可達上萬個；可用於基因結構分析，比如可變剪切
圖1 SMART-seq2原理
主要流程
訂購流程
備注：
1、《高通量測序送樣表_SMART-seq2送樣表》可從下載專區獲得
2、填寫好的表格需發送至項目助理郵箱：rna_sample@sangon.com
1、《高通量測序送樣表_SMART-seq2送樣表》可從下載專區獲得
2、填寫好的表格需發送至項目助理郵箱：rna_sample@sangon.com
項目流程
訂購信息
| 項目名稱 | 目錄價 | 周期 |
| SMART-seq2 | - | 40個工作日左右 |
客戶提供
提供樣品類型及運輸條件。
樣本要求
（ 1 ）物種：真核生物
（ 2 ）細胞：推薦1-100個單細胞
保存運輸
細胞放入 SMART-seq2 試劑盒指定的裂解液中，-80°C 保存，幹冰運輸。
（ 1 ）物種：真核生物
（ 2 ）細胞：推薦1-100個單細胞
保存運輸
細胞放入 SMART-seq2 試劑盒指定的裂解液中，-80°C 保存，幹冰運輸。
最終交付
交付信息
1.測序原始數據
2.實驗結果類文件
3.分析報告及分析結果文件
2.實驗結果類文件
3.分析報告及分析結果文件
分析結果示例
圖1基因表達相關性 heatmap 圖
圖2表達相關性散點圖
圖3 差異基因 Heatmap 圖
圖4差異表達基因的 GO 功能分類統計圖
圖5差異表達基因 GO 富集氣泡圖