單細胞免疫組庫測序服務簡介
項目介紹
免疫組庫(Immune repertoire,IR)是指在任何指定時間,某個個體的循環係統中所有功能多樣性B淋巴細胞和T淋巴細胞的總和,反應機體在特定時間段應對外界刺激應答的能力。傳統的免疫組庫研究通常是通過多重PCR技術或5’RACE擴增分析BCR或TCR多樣性的互補決定區(CDR3區),往往隻能檢測TCR或BCR一條鏈的序列信息。而單細胞免疫組庫測序能夠在單細胞的層麵研究機體免疫機製,可較為全麵的揭示TCR/BCR的多樣性和複雜性,是免疫組庫研究中的一個重要手段。目前基於10x Genomics公司的單細胞免疫組庫解決方案,可實現高通量的單細胞V(D)J測序,不但可以將TCR/BCR雙鏈完美匹配,而且可以細化到單細胞水平,還同時可獲得基因表達信息。
主要流程
1、訂購流程
備注:
1、《高通量測序送樣表-單細胞免疫組庫測序 》和《上門服務信息確認表-單細胞免疫組庫測序》可從下載專區獲得
2、填寫好的表格需發送至項目助理郵箱:rna_sample@sangon.com
1、《高通量測序送樣表-單細胞免疫組庫測序 》和《上門服務信息確認表-單細胞免疫組庫測序》可從下載專區獲得
2、填寫好的表格需發送至項目助理郵箱:rna_sample@sangon.com
2、項目流程
訂購信息
樣品類型及運輸條件
1、樣本類型
注意事項:
1、物種適用性:單細胞免疫組庫測序隻適用於人或小鼠的樣本;
2、用於製備單細胞核懸浮液的樣本無法進行單細胞免疫組庫實驗;
3、V(D)J 建庫建議先進行 T/B 細胞流式分選或磁珠富集,未富集樣本不會影響 5'轉錄組數據,但 T/B 細胞占比過低會
導致TCR/BCR 文庫建庫失敗。
1、物種適用性:單細胞免疫組庫測序隻適用於人或小鼠的樣本;
2、用於製備單細胞核懸浮液的樣本無法進行單細胞免疫組庫實驗;
3、V(D)J 建庫建議先進行 T/B 細胞流式分選或磁珠富集,未富集樣本不會影響 5'轉錄組數據,但 T/B 細胞占比過低會
導致TCR/BCR 文庫建庫失敗。
2、常見樣本運輸方式
3、提供信息:紙質版樣品信息表;無致病性證明。
最終交付
交付信息
1.測序原始數據
2.實驗結果類文件
3.分析報告及分析結果文件
2.實驗結果類文件
3.分析報告及分析結果文件
分析結果示例
圖1. V-J 基因使用熱圖
圖2. V-J 基因使用弦圖
圖3.V-J基因使用頻率條形圖
圖4. V-J paris使用衝擊圖