10x Visium空間轉錄組測序服務簡介
項目介紹
在多細胞生物中,基因的表達具有時間特異性和空間特異性,細胞及其在組織樣本中的相對位置之間的關係對於理解疾病病理、細胞生物學、發育生物學、腫瘤生物學等至關重要。而常規轉錄組測序和單細胞轉錄組測序都無法實現細胞所處的原始位置信息的檢測,且傳統的原位雜交技術通量比較低。來自10x Genomics公司的Visium空間基因表達解決方案,提供了分析空間整體轉錄組的方法,該方案通過將基因表達數據與形態H&E染色的圖像相疊加,研究人員可同時獲得細胞的空間位置信息和基因表達數據,且不需要製備單細胞懸液,進一步推進了對組織原位細胞真實基因表達的研究,實現了對細胞空間異質性的全麵描述。
主要流程
1、訂購流程
備注:
1、《高通量測序送樣表-空間轉錄組測序 》可從下載專區獲得
2、填寫好的表格需發送至項目助理郵箱:rna_sample@sangon.com"
1、《高通量測序送樣表-空間轉錄組測序 》可從下載專區獲得
2、填寫好的表格需發送至項目助理郵箱:rna_sample@sangon.com"
項目流程
1.新鮮組織冷凍包埋(FF樣本)
2.FFPE樣本
訂購信息
項目名稱 | 目錄價 | 周期 |
空間轉錄組測序 | / | 50個工作日左右 |
樣品類型
1.FF樣本:真核物種新鮮組織樣本
2.FFPE樣本:有物種限製
最終交付
交付信息
1.測序原始數據
2.實驗結果類文件
3.分析報告及分析結果文件
2.實驗結果類文件
3.分析報告及分析結果文件
分析結果示例
圖1. 點陣質控
圖2. 降維聚類UMAP圖(左)和cluster空間映射圖(右)
圖3 特異基因表達可視化