芯片名稱

芯片信息

Affymetrix Genome-Wide Human SNP Array 6.0

該芯片涵蓋超過1,800,000個遺傳變異標誌物：包括超過906,600個SNP和超過946,000個用於檢測拷貝數變化（CNV，Copy Number Variation）的探針

Affymetrix Mouse Diversity Genotyping Array

這款芯片與Human SNP 6.0 芯片類似，既包含SNP探針，也包含CNV探針。一共涵蓋623,124個SNP位點和916,269個CNV探針。

Affymetrix GeneChip Rice 44K SNP Genotyping Array

芯片覆蓋indica, aus, tropical japonica, temperate japonica, and group V (“aromatic”)多個水稻亞種的44,1000個SNP。 每10kb至少包括1個SNP，每個SNP設計12個探針技術重複相關係數R2 > 99%。

芯片名稱

芯片信息

Affymetrix GeneChip® Human Genome U133 Plus 2.0 Array

該芯片包含了47,000個轉錄本，代表了38,500個明晰的人類基因。數據庫來源於GeneBank、dbEST、RefSeq、UniGene database、Washington University EST trace repository、NCBI human genome assembly。

Affymetrix GeneChip Human Transcriptome Array 2.0

較高分辨率的基因芯片，支持所有轉錄本異構體的全轉錄組分析，包含超過六百萬條不同探針，覆蓋編碼和非編碼轉錄本。

該芯片為每個外顯子設計約10條探針，每個外顯子之間的剪接點有4條探針，確保每個實驗都能獲得完整、準確和可重複的數據。重複性高（批內相關係數≥0.99），所有檢測過的組織觀察到的變異係數（CV）<6.5%。樣品類型既包括新鮮凍存樣品，也包括FFPE 樣本。

Affymetrix GeneChip Human Gene 2.0ST Array

Affymetrix新一代全轉錄本芯片，在一張芯片上可以同時檢測mRNA和lincRNA， 與上一代1.0 ST Array相比，2.0 ST Array有更多的優點：全麵覆蓋轉錄組，可以同時檢測>30,000個編碼的轉錄本和>11,000個長鏈非編碼轉錄本；探針設計最大程度覆蓋所有外顯子，可檢測選擇性拚接/轉錄本變體。每個轉錄本覆蓋特異探針的數目中值達到21種，每種探針的長度為25bp，這意味著每個轉錄本將被檢測的堿基數中值高達525個；重複性高；靈敏度高。

Affymetrix GeneChip Mouse Gene 2.0 ST Array（

Affymetrix新一代全轉錄本芯片，在一張芯片上可以同時檢測mRNA和lincRNA， 與上一代1.0 ST Array相比，2.0 ST Array有更多的優點：全麵覆蓋轉錄組，可以同時檢測35,240個編碼的轉錄本和>2,000個lincRNA；探針設計最大程度覆蓋所有外顯子；重複性高；靈敏度高。

Affymetrix GeneChip Mouse Genome 430 2.0 Array

該芯片涵蓋了39,000個轉錄本，代表34,000個明晰的小鼠基因。序列信息基於GeneBank、dbEST、RefSeq、UniGene database。

Affymetrix GeneChip Rat Genome 230 2.0 Array

該芯片包含有31,000個probe sets，代表28,000個明晰的大鼠基因。序列信息基於GenBank , dbEST, RefSeq等權威數據庫。

芯片名稱

芯片信息

Affymetrix miRNA 4.0 Arrary

覆蓋miRBase v20數據庫，同時檢測203個物種的miRNA，信息量大-芯片結果包括：host gene ID、miRNA target genes、clustered miRNA等

Affymetrix miRNA 3.0 Arrary

含蓋Sanger miRBase V17.0數據庫，同時檢測153個物種的miRNA，同時檢測成熟miRNA和miRNA前體，能檢測人snoRNA和scaRNA