全基因合成流程進度說明
從接受到您的訂單開始,基因合成共分為六個主要步驟。在中間最主要的步驟04基因組裝中,又分成了連接轉化、克隆篩選、 測序驗證和突變修複四個子流程。同時,又由於組裝片段長度和載體的不同,分成了分片段組裝、全長片段組裝和客供載體組裝三個組裝類型。3 Kb以內的基因合成,不需要分片段組裝,可以直接進行全長片段組裝。pUC係列載體作為基因合成的標準 載體可免費提供。而客戶提供的指定載體,還需要額外的客供載體組裝這個步驟。更詳細的內容可通過下方流程圖及流程說明 表來得到明確釋意。
圖1:基因合成流程圖
表1:基因合成流程說明表
基礎 | 適用類型 | 流程說明 | ||||
pUC 57 載體 | 客供載體 | |||||
長度 ≤3 Kb | 長度>3Kb | 長度≤3 Kb | 長度>3 Kb | |||
01 方案設計 | √ | √ | √ | √ | 您的序列將進行進一步的分析,包括根據最終應用來 確定優化方案,GC含量、高度重複序列、複雜二級 結構、更長的片段長度等會給基因合成帶來更高的難 度。此期間我們會實時與您保持溝通並確認最佳實驗 方案。對於非常大的基因,通常要先拆分成 500~1000 bp的分片段,分別合成,然後再進行組 裝。引物的設計是進入生產前的重要步驟 | |
02 引物合成 | √ | √ | √ | √ | 使用Oligo化學合成的方式,合成帶有重疊區域的 40~200 nt的小片段引物 | |
03 寡核苷酸拚接 | √ | √ | √ | √ | 使用重疊PCR的技術,將單鏈的引物拚裝成雙鏈的基 因片段,對於3 Kb以內的且無複雜二級結構的基因, 可直接進入第4步全長組裝;如果您的基因全長超過 3 Kb,則需要進行分片段組裝 | |
04 基因組裝 | 04-1 分片段組裝 | √ | √ | 大於3 Kb的基因,需要先分成多個分片段並插入多個 pUC係列載體,經過連接轉化、克隆篩選和測序驗證 和突變修複,直到得到完全正確序的重組載體 | ||
04-2 全長片段組裝 | √ | √ | √ | √ | 通過無縫克隆或酶切等組裝技術,進一步將分片段拚接成全長後插入pUC係列載體,經過連接轉化、克隆篩選和測序驗證和突變修複,直到得到完全正確序的重組載體 | |
04-3 客供載體組裝 | √ | √ | 通過無縫克隆或酶切等組裝技術,進一步將分片段拚接成全長後插入客戶提供或指定的載體,經過連接轉化、克隆篩選和測序驗證和突變修複,直到得到完全正確序的重組載體 | |||
05 成品質檢 | √ | √ | √ | √ | 通過測序驗證、酶切電泳等方式對成品進行最終質量檢測 | |
06 等待發貨 | √ | √ | √ | √ | 您需要的貨品通過抽幹、分裝和包裝,已經在等待發貨了 | |
00 取消訂單 | 由於多種不可控因素,即便是多次嚐試和努力,基因合成仍存在一定程度的失敗概率,在和您協商一致的前提下,我們會選擇主動放棄嚐試並取消訂單。 |