複雜序列測序

發夾結構、高GC、重複序列、ITR 序列及Poly（A/T）等難度序列在測序過程中很難測通，在測序過程中很容易出現無信號、重疊峰的現象，同時也會出現即使雙端 測序仍無法測通的情況，為此，必威betway官方网站登录 成立了針對複雜序列測序的專項服務團隊。利用多項獨創的技術可以對難度序列進行準確測序，有效改善難度序列難以測通的 情況。

我們的優勢

複雜序列測序技術：博士領銜的專項研發團隊，分別針對發夾結構、高GC、ITR和Poly（A/T）等普通測序方法難以解決的複雜 序列進行技術攻堅，使用獨特的技術解決方案大幅提高了複雜序列的測序成功率；
專項服務團隊：以方案設計為核心，成立專項服務團隊，從序列分析開始，製定最優化的測序方案，通過多套專屬測序模板製備、測序反應流程的組合，最終交付給客戶最理想的測序結果。

訂購信息

腺相關病毒（Adeno-associated Virus，AAV）載體是以AAV基因組為骨架改造而來的基因遞送工具。腺相關病毒屬於細小病毒科的低致病性病毒，其兩端為末端反向重複序列（Inverted Terminal Repeat，ITR）。ITRs對於病毒的複製和包裝具有決定性作用。但ITRs中GC含量高，且具有回文性質，AAV質粒容易發生突變，普通測序難以測通。必威betway官方网站登录 獨創的技術可以對ITR結果進行準確測序，並幫助評估ITR區域是否發生突變以及ITR區域的完整性。

項目名稱	樣本類型	技術/設備平台	交付周期（工作日）	交付結果
ITR測序	質粒、菌樣	3730XL測序儀	10~15	ab1 格式的峰型彩圖 seq 格式的序列文件

案例展示

送樣要求

質粒

樣本量>=20 μl（每增加一個反應增加5 μl），樣本濃度>=200 ng/μl，純度 OD_260/280≥1.8且OD_260/230≥1.8；
測序引物要求：擴增及測序引物距ITR結構200 bp以內，最優範圍在80-200 bp；如需委托必威betway官方网站登录 設計合成測序引物，需提供質粒全序列；
質粒4°C冷藏運輸，幹粉質粒可常溫運輸。

訂購方式

下載 ITR測序訂購單 ，填寫後發送至 itrseq@sangon.com，由訂單中心技術人員處理您的價。
訂單中心電話：400-821-0268按鍵 2 後再按鍵 8

隨著對基礎生物功能認識以及人類健康水平的提高，基因治療手段及RNA疫苗將基於mRNA的研究推上新的浪潮。真核生物中，幾乎每條mRNA的尾部都會帶有多聚腺苷酸，即Poly(A)。Poly(A)尾在翻譯和控製mRNA穩定性中具有重要作用，但Poly(A/T)的測序依舊麵臨巨大挑戰。
必威betway官方网站登录 研發人員通過分析滑動產生的機製，最終製定出可以有效改善滑動產生的方法。常規情況下，該方法能夠將滑動由幾十nt縮小並固定在±3 nt以內，同時極大地提高主條帶的擴增比例，使得Poly結構後的第一個堿基峰值絕對顯著，從而達到單端測序便可判斷Poly結構長度的效果。

項目名稱	樣本類型	技術/設備平台	交付周期（工作日）	交付結果
Poly(A/T)測序	質粒	3730XL測序儀	谘詢	ab1 格式的峰型彩圖 seq 格式的序列文件

案例展示

連續Poly (A/T)測序（116 nt）

用常規方法檢測該Poly序列產生了前後各10 nt以上的滑動，即便加上正向引物的測序結果也無法判斷拚接的位置。但必威betway官方网站登录 新方法能夠主條帶比例顯著放大，從而判斷出Poly序列後第一個堿基的位置（★），從而確定Poly序列中重複堿基的數目。

不連續重複（30+74 nt）

對於不連續的重複序列測序，同樣存在因Poly後第一個堿基位置無法確定而導致正反向測序結果拚接失敗的現象。該方法能降低滑動底峰的同時實現僅正向引物便可確定重複堿基數目，而輔以反向測序結果能夠精準判斷。★Poly序列後第一個堿基。空白處對序列進行了隱藏。

送樣要求

樣本類型：質粒
樣本濃度>=150 ng/μl，體積>=20 μl，以Nanodrop儀器為準，OD_260/280>=1.8且OD_260/230>=1.8；
引物要求：距離Poly結構200 bp以內，最優為80-200 bp；
需注明載體全稱和插入目的片段長度及測序要求；
如有可能，同時提供200 μl含有相應質粒的菌液備用；
4°C冷藏運輸。

訂購方式

特別提示：訂購複雜序列測序，需在DNA測序訂購表的對應列上勾選複雜序列類型，並在底部勾選“按複雜序列訂購”，以獲取項目報價。 點此查看指導說明

除ITR結構、Ploy(A/T)結構等應用場景明確的複雜序列外。其他由於發夾結構、高GC含量及重複序列等因素的影響，常規的測序對於複雜序列的測序效果往往不是很理想。常規測序中常出現無信號的、重疊峰等情況。必威betway官方网站登录 獨創的技術可以對複雜序列進行測序，有效改善常規測序難以測通複雜序列的情況，大幅度提高複雜序列測序的成功率。

項目名稱	樣本類型	技術/設備平台	交付周期（工作日）	交付結果
Poly(C/G)測序	質粒	3730XL測序儀	谘詢	ab1 格式的峰型彩圖 seq 格式的序列文件
高GC	質粒

複雜序列類型及判定標準

類型	Poly(C/G)	高GC
判定標準	局部包含連續超過6 nt的C/G序列	總GC含量超過70%或者局部 （>50 nt）超過85%
案例說明	查看	查看

送樣要求

樣本類型：質粒
樣本濃度>=150 ng/μl，體積>=20 μl，以Nanodrop儀器為準，OD_260/280>=1.8且OD_260/230>=1.8；
引物要求：距離Poly結構200 bp以內，最優為80-200 bp；
需注明載體全稱和插入目的片段長度及測序要求；
如有可能，同時提供200 μl含有相應質粒的菌液備用；
4°C冷藏運輸。

訂購方式

特別提示：訂購複雜序列測序，需在DNA測序訂購表的對應列上勾選複雜序列類型，並在底部勾選“按複雜序列訂購”，以獲取項目報價。 點此查看指導說明